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Ich würde das nicht machen. Ich nehme an der Schnuller ist aus Plastik, da ist es schon nicht besonders gut, dass ihn dein Kind im Mund hat, aber wenn du ihn auch noch mit soviel Hitze in Berührung bringst, lösen sich wohl endgültig Plastikatome ab, die den ganzen Körper durcheinander bringen können.
Einige Inhaltsstoffe des Plastiks lassen den Körper z.B. glauben, sie seien Östrogene - das kann zu Unfruchtbarkeit bei Jungen führen und für junge Mädchen ist zu viel Östrogen sicher auch nicht gut.
Deshalb sollte man ja auch nicht mit Plastikgeschirr kochen, da sind die Keime wohl noch das geringste Problem.
Im Gegenteil, ein gesundes Maß an Schmutz und Keimen sind sogar sehr gut für die Entwicklung der Kinder, da sie dadurch ein besseres Immunsystem aufbauen und weniger oft an Allergien erkranken. (Ich bin keine Ökotante, auch wenn dieser Artikel wohl fast so klingt, das fällt sogar mir auf...)